Nature 子刊:手机摇身一变成为显微镜,对肿瘤进行突变检测

生物通报道 瑞典和美国的研究人员近日设计出一款精巧的显微镜,它可以利用手机上的摄像头来检测 DNA 测序反应的荧光产物,从而实现癌基因的突变分析。这项成果于本周发表在《Nature Communications》杂志上。

加利福尼亚大学洛杉矶分校的 Aydogan Ozcan 是这篇论文的通讯作者之一。他认为,突变分析和 DNA 测序为临床科学带来了不起的进步,不过,它们被限制在实验室规模,显然不能应用在资源匮乏或资源有限的环境中。

Ozcan 表示,利用移动显微镜来分析特定的目标序列,使得这种先进的诊断工具可以用在医院或实验室以外的场景。芝加哥大学的 Savas Tay 也认为,这种技术的开发是普及这些高端的分子病理学检测的一种尝试。他没有参与这项研究。

这款显微镜包含了两个电池供电的激光器,以检测不同的荧光基团。它带有一个白色 LED,用于明场成像。手机的相机镜头和外部镜头可提供大约 2.6 倍的放大。3D 打印的显微镜平台可以从三个方向操控样品的载玻片。

(图片来自 Nature Communications)

研究人员利用结肠癌细胞系和人类肿瘤样品,对目标 DNA 序列进行扩增和荧光标记,以便检测突变型或野生型的 KRAS。之后,他们利用这种手机显微镜,对测序产物进行成像。他们检测到 KRAS 基因中的一个点突变,大约存在于 30% 以上的结肠癌患者中。

芬兰分子医学研究所的 Johan Lundin 也认为,这种显微镜与测序策略的组合有另一个优势,那就是所检测的细胞和组织是完整的。Lundin 也没有参与这项研究。不过,他认为这个平台也存在一些限制。具体表现为,在那些资源不足的环境中,这种技术的可行性究竟如何。显然,样品制备仍然需要训练有素的实验室技术人员。

作者表示,微流体设备可以简化样品制备的工作,他们目前正在开发这样的解决方案。对于未来,Ozcan 表示,团队的目标是让这项技术更加经济、更加易用,而无需太多的培训。他们希望开发出更多的检测,对 KRAS 以外的突变进行检测。“这个平台可扩展到不同的癌症,实现不同类型的突变分析,”Ozcan 谈到。(生物通 薄荷)

原文检索

Targeted DNA sequencing and in situ mutation analysis using mobile phone microscopy

Nature Communications 8, Article number: 13913 (2017)doi:10.1038/ncomms13913

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