癌症基因组图谱 Nature 发文,揭示宫颈癌基因组特征
2017 年 1 月 23 日发表在《 Nature 》上的研究显示,美国癌症基因组图谱( TCGA )计划的科学家们确定了宫颈癌新的基因组和分子特征,这将有助于疾病的分类,推动靶向治疗,帮助每个患者找到最合适的治疗方法。
新研究通过对 178 个原发性宫颈癌的基因组综合分析发现,超过 70% 的肿瘤在两个重要细胞信号通路中的一个或两个中具有基因组改变。研究人员还意外地发现,一部分肿瘤并没有显示人乳头状瘤病毒( HPV )感染的证据。这一研究由美国国家癌症研究所( NCI )和国家人类基因组研究所( NHGRI )的科学家共同完成。
宫颈癌每年在全世界范围内造成超过 50 万的癌症新发病例,并导致超过 25 万人死亡。绝大多数宫颈癌是由致癌型 HPV 的持续感染引起的。致癌性高危 HPV 的有效预防性疫苗已存在多年,接种疫苗可以减少宫颈癌的发生。
Douglas Lowy 博士表示,世界卫生组织对于 HPV 疫苗推荐的接种年龄是 9 岁 -26 岁。然而,大多数在未来几十年内将发展为宫颈癌的女性实际上已经超过了推荐的接种年龄,并且不会受到疫苗的保护。因此,宫颈癌仍然是一种需要得到有效治疗的疾病,这种最新的癌症基因组图谱分析可以帮助并推动找到药物,靶向除了 HPV 基因以外的宫颈癌基因组重要元素。
研究结果的一个方面是特别令人感兴趣的,鉴定显示部分宫颈癌与子宫内膜癌具有分子相似性。这些子宫内膜样癌症主要是 HPV 阴性,并且它们都在 Kras,Arid1a 和 Pten 基因中具有高频率的突变。
通过对 HPV 阴性子宫内膜样肿瘤的鉴定证实,不是所有的宫颈癌都与 HPV 感染相关,并且一小部分宫颈癌可能是由于遗传或其他因素引起的。TCGA 办公室主任 Jean-Claude Zenklusen 认为,他们在过去的十年里已经观察了 30 多种肿瘤类型了,这是 TCGA 研究组最有趣的发现之一。
目前,免疫疗法对于癌症治疗变得越来越重要,所以研究人员检测了编码已知免疫靶标的基因以观察这些基因是否出现任何扩增,这可以预测患者对免疫疗法的响应性。他们发现几个这样的基因,特别是 CD274 (编码 PD-L1 免疫检查点蛋白)和 PDCD1LG2 (编码 PD-L2 免疫检查点蛋白)的扩增。以往的研究已经证明这几种检查点抑制剂是有效的免疫治疗剂。此外,TCGA 分析鉴定了宫颈癌中几种新的突变基因,包括 Med1,Erbb3,Casp8,Hla- a 和 Tgfβr2。研究人员还发现几个病例涉及 Bcar4 的基因融合,Bcar4 产生的长链非编码 RNA 已被证明能诱导对拉帕替尼(一种抑制乳腺癌中关键途径的口服药物)的反应。因此,Bcar4 可能是这种突变类型宫颈癌的潜在治疗靶标。
当分析这些肿瘤中分子改变背后的生物学时,研究人员发现,有近四分之三的宫颈癌患者在 PI3K / MAPK 和 TGF-β 信号通路中的一个或两个中出现基因组改变,这可以为治疗提供潜在靶标。另外,作者在本研究提出了一个重要问题: HPV 阳性和 HPV 阴性肿瘤对靶向治疗是否具有不同的反应?
参考资料:Integrated genomic and molecular characterization of cervical cancer. Nature , 2017.